Barcoding

Création d’une bibliothèque de séquences moléculaires de référence pour les Lépidoptères de France

Contexte et enjeux

Dans le cadre du programme national de suivi de la biodiversité terrestre piloté par PatriNat (OFB, MNHN, CNRS, IRD), les outils de biologie moléculaire prennent une place croissante dans l’étude et le suivi de la biodiversité. L’utilisation de l’ADN environnemental s’impose comme un outil important pour améliorer la connaissance et le suivi des communautés biologiques, notamment pour les insectes pollinisateurs comme le démontre le réseau thématique CNRS Pollinéco.

Le groupe des Lépidoptères, en raison de sa diversité et de son rôle fonctionnel dans la pollinisation nocturne au sein des écosystèmes, figure dans le dispositif de suivi européen des pollinisateurs (EU-PoMS). Pour appuyer ces études, il est essentiel de constituer une banque de données de séquences moléculaires de référence à partir de spécimens correctement identifiés et géoréférencés.

Notre action

L’association oreina s’est associée à PatriNat pour contribuer à la complétion d’un référentiel de séquences moléculaires pour les papillons de France métropolitaine. Ce projet, baptisé SEQREF, s’appuie sur l’infrastructure internationale BOLD (Barcode of Life Data System) et est piloté scientifiquement par l’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB – UMR 7205 CNRS/MNHN).

Notre approche comprend plusieurs volets :

1. Priorisation des espèces

Nous avons établi une liste priorisée des espèces à collecter en fonction de critères scientifiques :

• Absence de séquences en France dans BOLD
• Variabilité génétique connue
• Cas d’hybridation
• Localité-type en France

2. Animation d’un réseau de collecte

Nous avons mis en place un réseau national de référents régionaux composé de bénévoles chargés de :

• Coordonner localement la collecte des papillons
• Vérifier l’exactitude des données associées aux spécimens
• Préparer les envois vers le Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN)

3. Plateforme collaborative

La plateforme Artemisiae a été remaniée pour devenir l’outil central de suivi des contributions :

• Liste des espèces prioritaires consultable
• Enregistrement des dons de spécimens par les bénévoles
• Ajout de commentaires par espèce
• Suivi de l’avancement des envois vers les laboratoires